Den del af computerens hukommelse, der af MATLAB bruges til at huske de variable som oprettes, kaldes Workspace. Dette lager er kun aktivt, mens MATLAB programmet er åbent. Når MATLAB lukkes ned efter brug, vil der ikke automatisk blive gemt oplysninger om de aktuelle variable. Der er dog mulighed for at de variable kan blive lagret, hvis det ønskes. Se afsnit 1.4 side . Det er vigtigt at man befinder sig det rigtige sted i katalogtræet når man arbejder i MATLAB, så eksempelvis de gemte variable bliver gemt det rigtige sted. Ved at skrive pwd efterfulgt af RETURN retuneres der, hvilket katalog man befinder sig i. Man skifter rundt mellem katalogerne med den normale DOS kommando cd.